12月21日,清泉寺召开2006年度工作总结大会。水区政协副主席、统战部部长王朝明,水区区委统战部副部长常战民,水区民宗局局长卡哈曼·艾尼,水区民宗局副局长丁晓峰,市佛协秘书长殷尚武等领导参加了工作总结大会。水区民宗局副局长丁晓峰主持大会,市佛协会长寂仁法师代表清泉寺做了全面、客观的工作报告。

11月9日，清泉寺举办观音法会。

9月28日,参加“重走唐僧西行路”大型国际文化交流活动的明贤、慧在二位法师来到清泉寺朝拜，并对清泉寺的弘法状况进行了考察。

8月20日11时，圆湛法师的追悼会在乌鲁木齐市殡仪馆松鹤厅举行。追悼会由市佛协秘书长殷尚武主持，市佛教协会会长寂仁法师致悼词，圆湛法师家属代表致答谢词。参加圆湛法师追悼会的亲朋好友及佛教四众弟子约500人。追悼会庄严肃穆、秩序井然。

8月18日6时15分，清泉寺圆湛法师安祥示寂，世寿八十四岁。圆湛法师随北京法源寺正果法师剃度出家，后尊师嘱回新疆弘法，并参与建设清泉寺。法师一生简朴、乐善好施，曾任乌鲁木齐市佛协副会长。

8月8日（农历七月十五）盂兰盆会，清泉寺举办了延生和往生普佛。

7月7日至7月13日，清泉寺举办了为期一周的‘梁皇宝忏’法会。7月14日是农历六月十九佛教传统节日观音菩萨成道纪念日，清泉寺经过精心准备，虽然来往的香客摩肩接踵，但秩序竟然。

6月11日，乌鲁木齐市水磨沟区送法进寺院教育活动启动仪式在清泉寺举行。参加启动仪式的区领导有：区委常委沙塔尔·玛依尔、区政府副区长伊玛木·苏甫尔、区政协副主席、区委统战部部长王朝明，参加今天启动仪式的还有区有关部门的负责人：区司法局局长冯屏、区委统战部副部长常战民、区民宗局副局长卡合曼·艾尼、丁晓峰。市佛教协会会长寂仁法师做了发言，代表乌鲁木齐市佛教协会向区委、区政府对宗教界倾注的关心和关怀表示感谢，并向参加仪式的各位领导、护法居士们表示诚挚的祝愿。启动仪式结束后，区民宗局副局长丁晓峰进行了宗教法律法规知识宣讲。

6月6日，为期五天的清泉寺二〇〇六年共修法会正是开始，下午17点,寂仁法师主持了共修法会的洒净仪式。此次共修法会特意邀请了内地寺院的法师，目的是为了给新疆的佛教信众讲解正确的佛教教理和佛教礼仪，提高信众素质，弘扬正法，为以后的清泉寺走向正规打好基础。

5月30日,新疆师范大学宗教研究方面的老师、学生来到清泉寺进行宗教调研，受到了清泉寺住持寂仁法师的热情接待。

5月18日,清泉寺召开理事、主要部门会议，讨论今年寺院基础设施建设以及已经完成的项目所存在的问题。会议还对今后寺院管理制度的规范化和如何提高佛教信众的信仰素质，反对盲目信仰、迷信信仰等进行了热烈的讨论。

5月11日，市民委党组书记杜望成、副主任石希生，陪同自治区民委党组书记刘振强以及刘明处长、覃宏宇秘书长一行到清泉寺进行考察。

5月5日,清泉寺举办释迦牟尼佛诞辰纪念法会,进行浴佛活动和皈依仪式。

5月4日，清泉寺为期七天的“梁皇宝忏法会”圆满结束。这次法会正值五一假期，来参加的居士信众非常多，许多人都在大雄宝殿外边进行礼忏。虽然没有专门安排维护秩序的人员，但法会秩序非常好，充分体现了新疆居士信众的良好素质。下午，进行了放生活动。

4月4日上午,和田地区民宗委何书记及石河子市统战部刘部长等一行八人，在自治区佛教协会阿拉西副会长和乌鲁木齐市民宗委党组书记杜望成的陪同下，参观考察了水磨沟清泉禅寺。水磨沟清泉禅寺管委会副主任张玉莲、性通法师热情接待了来寺参观的地州领导。

2006年3月12——3月18，清泉寺举办了“观音菩萨大悲法会”。新疆地区的佛教信众参加法会活动的热情很高，法会秩序井然。

2006年3月9日，乌鲁木齐市佛教协会在清泉寺，举办为期一天的贯彻《宗教事务条例》学习班。参加学习班的人员有市佛教协会全体理事、清泉寺法明寺全体寺管会成员、常住寺院的宗教人士等26人。学习班会议由市佛教协会秘书长殷尚武主持，市佛教协会会长寂仁法师组织大家学习了《宗教事务条例》和宗教知识问答，并进行了辅导。会议还传达了乌鲁木齐市政协十届四次会议的精神，学习了《乌昌地区国民经济和社会发展“十一五”规划纲要（草案）》、全国人大会议政府工作报告摘要。

1月26日，市委、市政府对清泉寺住持寂仁法师进行了慰问。

1月24日,乌鲁木齐市佛教协会举办二〇〇六年迎新春茶话会,自治区民委许世杰、市统战部卡米江常委、自治区佛教协会阿拉西副会长、覃宏宇秘书长以及市民委主要领导等出席了茶话会。

2006年1月16日——1月20日，乌鲁木齐市佛教协会及佛教信众拿出5万元，对达坂城区、东沟乡小学的25名特困生资助，对东沟乡的少数民族残疾人，乌鲁木齐县水西沟乡、板房沟乡、青格达湖乡、四十户乡80多户少数民族特困户，市儿童福利院、精神病福利院、老年福利院进行慰问，慰问户数达100多户，人数约1000多人次。